Головная страница ИПМ Библиотеки, издания  •  Поиск публикаций  English 
Публикация

Препринт ИПМ № 78, Москва, 2021 г.
Авторы: Быстров В.С., Филиппов С.В.
Компьютерное моделирование и численные исследования пептидных нанотрубок на основе дифенилаланина
Аннотация:
Работа посвящена компьютерным исследованиям структурных и физических свойств таких самоорганизующихся структур, как пептидные нанотрубки на основе дипептида дифениланина с разными исходными изомерами левой и правой хиральностей этих дипептидов. Исследуемые структуры рассматриваются как с пустыми безводными, так и с заполненными молекулами воды внутренними полостями. Исследуются молекулярные модели как кольцевых, так и спиральных структур, согласующиеся с известными экспериментальными данными. Для исследования влияния внедренных во внутреннюю гидрофильную полость наноразмерных кластеров молекул воды, на свойства нанотрубок (включая изменение их дипольных моментов и поляризации), а также изменение структуры и свойств самих кластеров воды (их дипольный момент и поляризация), для обоих типов хиральности анализируются поверхности полостей нанотрубок и внешние поверхности водных кластерных структур. В том числе и при помощи специально разработанного метода визуального дифференциального анализа структурных особенностей (био)макромолекулярных структур. Полученные результаты расчетов ряда физических свойств (поляризации, и др.) приведены для различных случаев и проанализированы в сравнении с известными данными. Эти данные необходимы для анализа взаимодействий молекул воды с гидрофильными частями молекул нанотрубок на основе дифенилаланина, такими как COO- и NH3+, т.к. они определяют многие свойства структур. Ряд полученных данных планируется использовать для дальнейшего анализа возможной адгезии и захвата агентов определенных медицинских молекулярных агентов (компонентов) активными слоями нанотрубок на основе дифенилаланина, что может быть полезно для создания на их основе капсул адресной доставки фармацевтических препаратов и лекарств.
Ключевые слова:
дифенилаланин, пептидные нанотрубки, самоорганизация и самосборка, кластеры молекул воды, молекулярное моделирование, теория функционала плотности, квантовые полуэмпирические методы, визуально-дифференциальный метод анализа структур, дипольные момент, поляризация, хиральность
Язык публикации: русский,  страниц: 54
Направление исследований:
Математическое моделирование в актуальных проблемах науки и техники
Полный текст на русском языке:
Экспорт ссылки на публикацию в формате:   RIS    BibTeX
Статистика просмотров (обновляется раз в сутки):
за последние 30 дней — 19 (+19), всего с 11.11.2021 — 19
Сведения об авторах:
  • Быстров Владимир Сергеевич,  orcid.org/0000-0003-1487-9469ИПМ им. М.В. Келдыша РАН
  • Филиппов Сергей Валерьевич,  orcid.org/0000-0002-6378-491XИПМ им. М.В. Келдыша РАН