Головная страница ИПМ Библиотеки, издания  •  Поиск публикаций  English 
Публикация

Препринт ИПМ № 40, Москва, 2019 г.
Авторы: Тихонов Д.А., Куликова Л.И., Ефимов А.В.
Исследование межспиральных расстояний в спиральных парах белковых молекул
Аннотация:
В данной работе проведен анализ распределения межспиральных расстояний в парах связанных между собой перетяжками спиралей в пространственных структурах белковых молекул. Были разработаны правила отбора спиральных пар в структурах белковых молекул из Банка белковых структур (Protein Data Bank). Полученное множество спиральных пар было проанализировано с целью его классификации и установления закономерностей структурной организации. Предложена точечная модель двухспирального мотива. По критерию пересечения проекций спиралей на параллельные плоскости, проходящие через оси спиралей, полученное множество разбито на три подмножества. В работе получены гистограммы распределения всех типов спиральных пар в зависимости от расстояний между спиралями. Представлены статистические оценки распределений межплоскостного и минимального расстояний для спиральных пар различных типов, принадлежащих различным множествам.
Ключевые слова:
структурные мотивы белков, спиральные пары в белковых молекулах, точечная модель, статистический анализ, межплоскостное расстояние, минимальное расстояние между осями спиралей
Язык публикации: английский, страниц: 21
Направление исследований:
Математическое моделирование в актуальных проблемах науки и техники
Полный текст на английском языке: Сведения об авторах:
  • Тихонов Дмитрий Анатольевич,  orcid.org/0000-0002-1779-464X,  ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, ИТЭБ РАН
  • Куликова Людмила Ивановна,  orcid.org/0000-0002-7293-1504,  ИПМ им. М.В. Келдыша РАН
  • Ефимов Александр Васильевич,  orcid.org/0000-0002-9539-270X,  Институт белка РАН