На основе модели Холстейна в полуклассическом приближении численно исследуется динамика заряда в однородных цепочках сайтов с концами, имитирующими донор и акцептор. Для учета температуры используется ланжевеновский термостат. Ранее было показано, что в однородных цепочках разрушение поляронных состояний зависит не только от температуры термостата, но и от количества сайтов, т.е. от тепловой энергии цепочки. В данной работе проведены расчеты времени выхода из начального состояния «заряд локализован на доноре» к термодинамическому равновесию в зависимости от длины цепочки при фиксированной температуре. Промоделированы фрагменты ДНК вида GA…AGGG и GT…TGGG. Результаты расчетов сопоставлены с данными биофизических экспериментов по переносу дырки в гетерогенных последовательностях ДНК.

модель Холстейна, уравнение Ланжевена, время выхода к термодинамически равновесному состоянию, перенос заряда в ДНК

Математическое моделирование в актуальных проблемах науки и техники

Фиалко Надежда Сергеевна,  ,  orcid.org/0000-0001-9850-4036,  ИПМ им. М.В. Келдыша РАН

Лахно Виктор Дмитриевич,  ,  orcid.org/0000-0001-9224-769X,  ИПМ им. М.В. Келдыша РАН