Флуоресцентная гибридизация in situ (FISH) представляет собой молекулярный цитогенетический метод. Он предоставляет мощный инструмент для понимания генетических и геномных процессов, диагностики генетических нарушений и изучения структуры и функций генов и хромосом. В данной работе предложен метод автоматической объектной сегментации препаратов ядер клеток крови и метод обнаружения хромосом с целью дальнейшего изучения их на предмет хромосомного мозаицизма. На основе данных, предоставленных лабораторией Института биологии и биомедицины Университета Лобачевского, была обучена модель глубокого обучения SOTA YOLOv8-seg. Это стало возможным благодаря разметке небольшой части из 87 изображений. Эксперимент по обучению модели сегментации продемонстрировал очень хорошие показатели качества: точность = 0,940, полнота = 0,980, mAP[0,5] = 0,991 и mAP[0,5:0,95] = 0,764. После этого был предложен метод обнаружения хромосом, основанный на классических принципах обработки изображений и компьютерного зрения из-за отсутствия необходимых размеченных данных.

Флуоресцентная гибридизация, обработка изображений, семантическая сегментация, глубокие нейронные сети

Трыкин Александр Михайлович,  ,  orcid.org/0000-0002-5731-9624,  Нижегородский государственный университет имени Н. И. Лобачевского